Zespół naukowców z Collegium Medicum im. Ludwika Rydygiera w Bydgoszczy Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu opracował innowacyjną aplikację ChordSurv narzędzie, które w nowatorski sposób łączy zaawansowaną wizualizację danych z analizą statystyczną i analizą przeżycia. Rozwiązanie zostało stworzone z myślą o badaczach pracujących z dużymi i złożonymi zbiorami danych biomedycznych, odpowiadając na rosnącą potrzebę czytelnej, kompleksowej i publikacyjnej prezentacji wyników badań.
Autorem aplikacji jest dr hab. Maciej Gagat, prof. UMK, kierownik Katedry Histologii i Embriologii Collegium Medicum UMK. Projekt rozwijany jest wspólnie z doktorantami Katedry: mgr Klaudią Bonowicz-Kozłowską, mgr Dominiką Jerką oraz mgr Damianem Twardakiem i stanowi przykład efektywnego połączenia doświadczenia naukowego z nowoczesnymi technologiami informatycznymi.
ChordSurv umożliwia tworzenie wielopoziomowych diagramów cięciw, które pozwalają w przejrzysty sposób przedstawiać relacje pomiędzy grupami i kategoriami danych. W odróżnieniu od klasycznych narzędzi do wizualizacji, aplikacja integruje w jednym wykresie nie tylko strukturę danych, ale również wyniki analiz statystycznych oraz analiz przeżycia. Dzięki temu użytkownik może przygotować kompletną rycinę naukową spełniającą wymagania współczesnych czasopism naukowych.
Program oferuje możliwość prezentacji wyników testów statystycznych, wykresów kolumnowych, pudełkowych i punktowych, wykresów korelacji z linią regresji oraz analiz przeżycia metodą Kaplana–Meiera. Użytkownik może jednocześnie analizować zależności pomiędzy zmiennymi oraz przedstawiać ich znaczenie statystyczne w jednej spójnej wizualizacji.
Aplikacja została wyposażona w szereg funkcji ułatwiających codzienną pracę badaczy. Obsługuje import danych z plików CSV, XLSX i JSON, umożliwia eksport wysokiej jakości grafik wektorowych i rastrowych, oferuje szerokie możliwości personalizacji wykresów oraz pracę zarówno w języku polskim, jak i angielskim.
ChordSurv może znaleźć zastosowanie w naukach medycznych, biologicznych, farmaceutycznych, weterynaryjnych oraz wszędzie tam, gdzie analizowane są złożone zależności pomiędzy wieloma zmiennymi. Twórcy podkreślają, że celem projektu było stworzenie narzędzia, które nie tylko usprawni analizę danych, lecz przede wszystkim podniesie jakość ich prezentacji w artykułach naukowych, rozprawach doktorskich, grantach badawczych oraz wystąpieniach konferencyjnych.
Projekt jest stale rozwijany w Katedrze Histologii i Embriologii Collegium Medicum UMK, a kolejne wersje programu powstają w odpowiedzi na potrzeby środowiska naukowego oraz sugestie użytkowników z kraju i zagranicy. Równolegle przygotowywana jest publikacja naukowa opisująca zastosowane rozwiązania oraz ich potencjał w analizie i prezentacji danych biomedycznych.
Najnowsza wersja programu – ChordSurv v1.2.3 – jest dostępna bezpłatnie pod adresem: https://atlashistologiczny.pl/apps/chordsurv.html.
Twórcy mają nadzieję, że ChordSurv stanie się jednym z narzędzi wspierających nowoczesną komunikację naukową i będzie wykorzystywany przez badaczy na całym świecie do przygotowywania wysokiej jakości wizualizacji wyników badań.
