Katedra i Zakład Chemii Fizycznej
Katedra i Zakład Chemii Fizycznej

prof. dr hab. n. chem.
Piotr Cysewski

Kierownik Katedry i Zakładu

ul. Kurpińskiego 5
85-950 Bydgoszcz

tel. 52 585-36-14


Sekretariat:

mgr inż. Anna Cieślińska
tel. 52 585-36-11

Katedra i Zakład Chemii Fizycznej

Strona własna jednostki: http://chemfiz.cm.umk.pl/ 

Pracownicy:

Adiunkci:

Asystenci:

Pozostali pracownicy:

  • mgr inż. Anna Cieślińska - specjalista nauk.-techn.
  • inż. Tomasz Miernik - samodzielny referent




Tematyka badawcza:

GRUPA TEMATYCZNA A
Opis właściwości zasad azotowych oraz ich pochodnych zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego.

  • Reaktywność chemiczna
    Charakterystyka takich właściwości jak równowagi tautomeryczne, właściwości kodujące, parametry elektrostatyczne w oparciu o metodykę in silica
    Realizacja: dr hab. Piotr Cysewski, prof. UMK

  • Oddziaływania boczne (stakingowe)
    Charakterystyka zdolnościach stakujących nukleozydów zmodyfikowanych i porównanie z analogicznymi właściwościami kanonicznych nukleozydów
  • Trwałość wiązania N-glikozydowego
    Wyznaczenie energii wiązania N-glikozydowego oraz mechanizmu nieenzymatycznej hydrolizy nukleozydów.
  • Właściwości trifosforanów
    Opis właściwości trifosforanów zmodyfikowanych działaniem rodnika hydroksylowego.
    Realizacja: dr Beata Szefler

  • Modelowanie sfer solwatacyjnych
    Wyznaczenie różnic w oddziaływaniach z cząsteczkami polarnego oraz i niepolarnego rozpuszczalnika oraz charakterystyka struktury solwatacyjnej
    Realizacja: mgr Katarzyna Kozłowska

  • Opis wpływu środowiska na właściwości parowania zasad azotowych oraz ich wolnorodnikowych pochodnych
    Charakterystyka zdolności kodujących z uwzględnieniem wpływu zjawisk solwatacyjnych.
    Realizacja: dr hab. Piotr Cysewski, prof. UMK


GRUPA TEMATYCZNA B
Projektowanie molekularne leków oraz opis mechanizmów ich działania - modelowanie reakcji enzymatycznych

  • Opis właściwości wybranych leków interkalujacych
    Charakterystyka strukturalna, energetyczna oraz dynamiczna wybranych związków chemicznych o charakterze leków interkalujących oraz ich oddziaływań z cząsteczką DNA
  • Opis właściwości przeciw-uzależnieniowych ibogainy i jej pochodnych

  • Opis właściwości chemicznych oraz aktywności biologicznej pochodnych kwasu 1,2,4-triazoloakrylowego
    Charakterystyka strukturalna, energetyczna, elektrostatyczna, właściwości kwasowo-zasadowych pochodnych kwasy TrA i jego pochodnych.

  • Mechanizm hydrolizy glikozydów zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego

  • Mechanizm hydrolizy trifosforanów do difosforanów nukleozydów zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego

  • Metodyka enzymologii obliczeniowej

Najważniejsze publikacje z ostatnich lat:

  1. P. Cysewski, R. Oliński,
    Structural, electronic and energetic consequences of epigenetic cytosine modifications.
    Phys. Chem. Chem. Phys. 2015 : Vol. 17, s. 19616-19624.
  2. P. Cysewski, M. Przybyłek, T. Miernik, M. Kobierski, D. Ziółkowska,
    On the origin of surfaces-dependent growth of benzoic acid crystal inferred through the droplet evaporation method.
    Struct. Chem. 2015 : Vol. 26, s. 705-712.
  3. M. Przybyłek, P. Cysewski, M. Pawelec, Dorota Ziółkowska, M. Kobierski,
    On the orgin of surface imposed anisotropic growth of salicylic and acetylsalicylic acids crystals during droplet evaporation.
    J. Mol. Model. 2015 : Vol. 21, s. 49, 1-12.
  4. M.V. Diudea, B. Szefler,
    Topology of C20 based spongy nanostructures.
    Comput. Meth. Sci. Technol. 2015 : Vol. 21, nr 2, s. 65-68.
  5. M.V. Diudea, B. Szefler,
    Cluj and omega polynomials in PAHs and fullerenes.
    Curr. Org. Chem. 2015 : Vol. 19, nr 4, s. 311-330.
  6. M.V. Diudea, B. Szefler, C.L. Nagy, A. Bende,
    Exotic allotropes of carbon (Exotic properties of carbon nanomatter: : advances in physics and chemistry).
    Carbon Materials: Chemistry and Physics 2015 : Vol. 8, s. 185-201
  7. P. Czeleń, B. Szefler,
    Molecular dynamics study of the inhibitory effects of ChEMBL474807 on the enzymes GSK-3β and CDK-2.
    J. Mol. Model. 2015 : Vol. 21, s. 74, 1-8.
  8. B. Szefler, M.V. Diudea,
    Spongy nanostructures.
    J. Nanosci. Nanotechnol. 2015 : Vol. 15
  9. T.E. Harsa, A.M. Harsa, M.V. Diudea, B. Szefler,
    QSAR and docking studies of dopamine derivatives by similarity cluster prediction.
    Rev. Roum. Chim.2015 : Vol. 60, nr 7-8, s. 727-733.
  10. B. Szefler, T.E. Harsa, A.M. Harsa,
    QSAR and docking study on indolizines by similarity clustering.
    Stud. Univ. Babes-Bolyai Chem. 2015 : Vol. 60, nr 4, s. 201-212.
  11. R. Maties, B. Szefler, M.V. Diudea,
    QSAR study on dioxins.
    Stud. Univ. Babes-Bolyai Chem. 2015 : Vol. 60, nr 4, s. 193-200.
  12. P. Krawczyk,
    Time-dependent density functional theory calculations of the solvatochromism of some azo sulfonamide fluorochromes.
    J. Mol. Model. 2015 : Vol. 21, s. 118, 1-18.
  13. B. Jędrzejewska, M. Gordel, J. Szeremeta, P. Krawczyk, M. Samoć,
    Synthesis and linear and nonlinear optical properties of three push-pull oxazol-5(4H)-one compounds.
    J. Org. Chem. 2015 : Vol. 80, s. 9641-9651.
  14. P. Cysewski,
    Apparent basicities of the surfaces characterizing the dominant crystal habits of distinct polymorphic forms of 4-aminosulfonamide.
    J. Mol. Model. 2014 : Vol. 20 s. 2276, 1-10.
  15. E. Makarewicz, P. Cysewski, A. Michalik, D. Ziółkowska,
    Properties of acid or alkali treated cadmium pigments.
    Dyes Pigments 2013 : Vol. 96 s. 338-348.
  16. B. Jędrzejewska, P. Krawczyk, M. Pietrzak, M. Gordel, K. Matczyszyn, M. Samoć, P. Cysewski,
    Styryl dye possessing donor-π-acceptor structure - synthesis, spectroscopic and computational studies.
    Dyes Pigments 2013 : Vol. 99 s. 673-685.
  17. P. Czeleń, P. Cysewski,
    Structural and energetic properties of canonical and oxidized telomeric complexes studied by molecular dynamics simulations.
    J. Mol. Model. 2013 : Vol. 19 s. 3339-3349.
  18. P. Cysewski, T. Jeliński,
    Accuracy of color prediction of anthraquinone dyes in methanol solution estimated from first principle quantum chemistry computations.
    J. Mol. Model. 2013 : Vol. 19 s. 4089–4097.
  19. P. Cysewski,
    Structural origin of apparent surface basicities of p-aminosulanamide polymorphs.
    Cryst. Res. Technol. 2013 : Vol. 48 s. 1055–1065.
  20. T. Jeliński, P. Cysewski, E. Makarewicz
    Application of alizarin colorimetric measurements for quantification of amine extraction by model food simulants from epoxy polymer
    SpringerPlus 2013 : Vol. 2 s. 593-603.
  21. P. Cysewski
    Application of aromaticity indices as molecular descriptors for prediction of optical properties of 9,10-anthraquinone derivatives in ethanol solution
    Journal of Theoretical and Computational Chemistry 2013 : Vol. 12 nr 6 s. 130050-1-130050-1.